Biologické centrum AV ČR, v. v. i., je veřejná výzkumná instituce, založená v roce 2006 Akademií věd České republiky. Nachází se v Českých Budějovicích ve společném areálu s Jihočeskou univerzitou.
Sdružuje pět původně samostatných vědeckých pracovišť a Středisko služeb zabezpečující administrativní a technické služby. Je největším mimopražským ústavem Akademie věd České republiky a jednou z významných institucí s daným výzkumným profilem v Evropě.
Biologické centrum AV ČR má tyto organizační součásti: Entomologický ústav, Ústav molekulární biologie rostlin, Parazitologický ústav a Středisko služeb, které sídlí v samostatných budovách hlavního kampusu (Branišovská 31). Hydrobiologický ústav a Ústav půdní biologie jsou umístěny v bezprostřední blízkosti (Na Sádkách 7).